日本の神道・仏教における根本的な部分には「陰陽道」があり、その陰陽道のルーツは中国道教にあります。
その陰陽道（道教）の陰陽五行説にちなんだ十二支（干支）を東方プロジェクトの神主ZUN氏なら意識していてもおかしくないはずです。（すでに東方神霊廟にて道教の設定を出してきている。）
※確実に動物と言えるものは○、妖怪や象徴的なものは△と明記した。
子（ね：ネズミ）…○ナズーリン
丑（うし：ウシ）…△上白沢慧音
寅（とら：トラ）…○寅丸星
卯（う：うさぎ）…○鈴仙・優曇華院・イナバ、因幡てゐ
辰（たつ：竜）…△紅美鈴、永江衣玖
巳（み：ヘビ）…△八坂神奈子
午（うま：馬）…△豊聡耳神子
未（ひつじ：羊）…☓
申（さる：サル）…△古明地さとり、古明地こいし、幽谷響子
酉（とり：鳥）…○ミスティア・ローレライ、射命丸文、姫海棠はたて、霊烏路空
戌（いぬ：犬）…○犬走椛
亥（い：イノシシ）…☓
こうして並べてみると、割と十二支を意識しているのではないか…？
という意図も見て取れます。
△に関する補足事項：
・丑（うし：ウシ）の上白沢慧音は、未来予知をする件（クダン）という牛の妖怪から。
・辰（たつ：竜）の紅美鈴は竜は神獣・霊獣であり、『史記』における劉邦出生伝説以来、中国では皇帝のシンボル。永江衣玖はリュウグウノツカイという地震予知の深海魚。
・巳（み：ヘビ）の八坂神奈子は、ミシャグジ神でカエルの洩矢諏訪子に対して、ヘビという位置づけ。
・午（うま：馬）の豊聡耳神子は、聖徳太子の厩戸皇子から。
・申（さる：サル）の古明地さとり、古明地こいしは、岐阜県の山奥に住む心を読むサルの妖怪。玃猿（かくえん）という。同じく幽谷響子こと「妖怪やまびこ」も妖怪さとりと同じく玃猿（かくえん）の仲間。
未（ひつじ：羊）に関して、マエリベリー・ハーンが通称メリーと呼ばれるので１８５０年にセイラー・ジョセファ・ヘイルさんが作詞作曲した「メリーさんの羊」を考慮しました。
しかし原文では「Mary（メアリー）」になっており、「Merry（メリー）」ではありませんでした。
これは日本語で歌う時の語呂を考慮して「メアリーさんの羊」ではなく「メリーさんの羊」にしたのだと思います。
ということは、メリーの綴（つづ）りは「Merry（メリー）」（クリスマスでメリー・クリスマスとかいうアレ。活発な、陽気な、という意味。）なので、羊（Sheep）とは関係ないようです。
というわけで、残っているのは「ヒツジ」と「イノシシ」。
日本にヒツジの妖怪はいないので、海外の妖怪の設定を出す必要があります。
もしくは妖怪「枕返し」、妖怪「夢うつし」、妖怪「夢喰い獏（ばく）」を元ネタに、「羊が一匹〜…羊が二匹…」の設定をつける必要があります。
（元々、羊を数えて眠る手法は、英語で「ワンシープ、ツーシープ」と睡眠のスースーという擬音を刷り込むことで効果があるものなので、日本語で数えても効果を感じないのはこのためです。）
イノシシに関しては、妖怪だと妖怪「一本だたら」くらいしかいません。
一本だたら
http://ja.wikipedia.org/wiki/%E4%B8%80%E6%9C%AC%E3%81%A0%E3%81%9F%E3%82%89
今後、これが元ネタにされることを期待したいですね。
参考：「ZUN氏（神主）の読書歴史【総まとめ】 〜何が東方のゲームに影響を与えたか〜」
http://netkudoku.seesaa.net/article/149911695.html
より、妖怪本抜粋。
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